يؤدي تجلط الوريد البابي إلى ارتفاع ضغط الوريد البابي، ومن ثم إلى نزيف معدي معوي. يعتمد التشخيص على الموجات فوق الصوتية. يهدف العلاج بشكل رئيسي إلى السيطرة على نزيف الجهاز الهضمي والوقاية منه (عادةً بالتنظير الداخلي أو حقن أوكتريوتيد وريدي)، وأحيانًا باستخدام مجازة وعائية أو حاصرات بيتا؛ ومن الممكن حدوث انحلال الخثرة في حالات الخثار الحاد.