يعتبر اكتشاف وتمييز الأوليات (أي التمييز بين الأشكال الممرضة من الأشكال غير المسببة للأمراض) مهمة معقدة إلى حد ما. تم العثور على معظم الكائنات الحية وحيدة الخلية في البراز في شكلين: الخضري (المرحلة أتروفة) - نشط، المحمول، ونشاط الحياة، بسهولة آثار قابلة الضارة (في التبريد معين) ويموتون هكذا بسرعة بعد العزلة من الأمعاء، وكما مقاومة للالخراجات التأثيرات الخارجية ( بيض التوكسوبلازما).
