وتنقسم جميع البروبيوتيك إلى عدة مجموعات ، اعتمادا على ما هو أساس التصنيف. قد تحتوي تركيبة الكائنات الحية المجهرية على عدة مكونات ، في هذا الصدد ، يتم عزل المستحضرات أحادية العنصر ، التي تحتوي على نوع واحد محدد فقط من البكتيريا. هذه الكائنات الدقيقة هي بلا شك مفيدة للأمعاء ، ولا سيما بالنسبة للميكروفلورا.