هناك 6 تراكيب وراثية و 11 نوعًا رئيسيًا من فيروس التهاب الكبد الوبائي ، ويسبب النمط الجيني 1 ، خاصة 1 ب ، مسارًا أكثر شدة للمرض وأكثر مقاومة للعلاج. في هذه الحالة ، يتم تسجيل مستوى أعلى من viremia عادة. على أساس التغاير الوراثي لسلالات HCV ، قيل إن اختلاف الأنماط الجينية لفيروس التهاب الكبد C حدث قبل حوالي 300 سنة.