تسبب الجزيئات الدقيقة للجينات المجاورة على الكروموسوم عددا من المتلازمات النادرة جدا (Prader-Willi، Miller-Dicker، Di-Georgie، etc.). أصبح تشخيص هذه المتلازمات ممكنًا بسبب تحسين طريقة تحضير الاستعدادات للكروموسوم. في حالة عدم اكتشاف microdeletion بواسطة تنميط karyotyping ، يتم استخدام اختبارات DNA المحددة للمنطقة التي خضعت للحذف.